安徽中医药高等专科学校前身为创建于1960年的芜湖市中医学校，2002年经教育部批准，学校在全国同类院校率先独立升格为“安徽中医药高等专科学校”。为整合卫生教育资源，2006年、2012年，芜湖市委、市政府先后将市中医医院、市口腔医院成建制整体划归学校。近年来，在市委、市政府的领导下，在省委教育工委、省教育厅的指导下，学校办学规模不断扩大、办学实力日益增强、办学特色更加彰显，学校现为全国中医药职业教育教学指导委员会副主任委员单位、安徽省中医药现代化研究会理事长单位、安徽省技能型高水平大学建设单位、安徽省联合培养普通专升本学生试点院校、安徽省“三全育人”综合改革试点院校，目前学校正在奋力创建中医药特色鲜明的应用型本科院校。